A 32 éves hátvéd már D-jugoristaként csatlakozott a freiburgi futballiskolához, majd 2012 januárjában mutatkozott be a Bundesligában. A Borussia Dortmundnál és a Borussia Mönchengladbachnál eltöltött időszakok után 2022 nyarán tért vissza Freiburgba, azóta pedig a csapat egyik legfontosabb pillérévé vált.
Ginter eddig összesen 255 alkalommal lépett pályára a SC színeiben, ezalatt 20 gólt szerzett és 19 gólpasszt adott. Jochen Saier, a freiburgi vezetőség tagja méltatta a védőcsapatkapitány teljesítményét és töretlen ambícióját.
Ginter a Bildnek elmondta, hogy a klubbal nőtt fel, gyerekként a Dreisamstadion gyermekszektorában állt, és maximálisan ambiciózusan szeretnék továbbírni a közös sikertörténetet.