Miután közös megegyezéssel bontottak Cuestával, a sárga-kékek a 2006-os világbajnok volt csatárában találták meg a megfelelő embert a első csapat élére. Gilardino a 2026/2027-es idény végéig szóló szerződést írt alá, amely egy további két évre szóló opciót is tartalmaz a klub javára.
A Pisa kispadján 2025 júliusa és 2026 februárja között megfordult edző számára ez egyben visszatérés is, hiszen 2002 és 2005 között játékosként 116 mérkőzésen 56 gólt szerzett a Parmában.
Az új vezetőedző korábban a Rezzato, a Pro Vercelli, a Genoa és a Pisa csapatait is irányította.