A spanyol vezetőedző irányításával a Serie A-ban szereplő Como remekül kezdett az európai elitsorozatban: a Leipzig, a Manchester United és a Lens legyőzésével négy mérkőzésből kilenc pontot gyűjtöttek, és újoncként a negyedik helyen állnak. A klub az olasz másodosztály alsó házából emelkedett fel a Bajnokok Ligájáig, ami a modern kor egyik legfigyelemreméltóbb sikertörténete.
Fàbregas 2022-ben igazolt a klubhoz játékosként, majd 2024 júliusában nevezték ki végleges vezetőedzőnek. A forrás szerint Fàbregas korábban nyilatkozott arról a RAC1-nek, hogy álma lenne egyszer gyerekkori klubját, a Barcelonát edzeni, bár pályafutása során az edzői szerepköröket tekintve kijelentette, hogy nem szeretne asszisztens lenni.
Egy májusi nyilatkozatában a Real Madrid esetleges irányításáról úgy fogalmazott, hogy még nem is gondolt rá vagy vette fontolóra a lehetőséget.