Martin Skrtel nyolc és fél évet töltött a Liverpoolnál, ahol Rafa Benítez szerződtette, majd Brendan Rodgers irányításával is fontos játékos volt. Miután Jürgen Klopp 2015 októberében átvette a csapat irányítását, Skrtel kezdetben megőrizte helyét, de egy decemberi sérülés miatt háttérbe szorult, és a felépülése után már csak öt mérkőzésen lépett pályára. 2016 nyarán botrány keveredett köré, miután a hivatalos Instagram-fiókjából válaszoltak egy olyan bejegyzésre, amelynek hashtaggel ellátott szövege sértő kifejezést használt Kloppra.
A profilról érkező válaszok azt sugallták, hogy a szerző reméli, a német vezetőedző is látja az írást. A Daily Mirror beszámolója szerint Skrtel 2016 júniusában elhatárolódott a történtektől, és bocsánatot kért, de hangsúlyozta, hogy nem ő, hanem a közösségi oldalait kezelő barátja írta a hozzászólásokat.
A bocsánatkérés ellenére a védőt júliusban eladták a Fenerbahcénak 5,5 millió fontért. Skrtel később, 2016 szeptemberében úgy nyilatkozott, hogy hálás a liverpooli edzőinek, és csodálatos embernek nevezte Kloppot, valamint kijelentette, hogy a jövőben is a Liverpool szurkolója marad.
